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水产南繁种业创新中心茅云翔团队在红藻热激蛋白20基因超家族(Hsp20)演化与功能多样性研究方面取得新进展
来源:水产南繁种业创新中心 时间:2022-03-29 19:21 查看:0

近日,海南热带海洋学院崖州湾创新研究院茅云翔教授团队在TOP期刊Frontiers in Plant Science(《植物科学前沿》)发表了题为Heat Shock Protein 20 Gene Superfamilies in Red Algae: Evolutionary and Functional Diversities”(红藻热激蛋白20基因超家族:演化与功能多样性)的研究成果,该研究为红藻Hsp20基因家族提供了全面和有价值的信息,并为其功能表征奠定了基础。

 

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研究背景

热激蛋白20Hsp20)在植物生长、发育和对环境胁迫的响应过程中发挥着重要作用。然而,Hsp20基因超家族在红藻(Rhodophyta)中尚未被系统地研究,其在红藻中的功能还不清楚。

 

研究结果

针对上述科学问题,茅云翔团队对红藻Hsp20基因家族进行了全面系统的分析,对其基因结构、保守基序、系统发育关系、染色体定位、基因复制、顺式调控元件和表达模式等方面进行了研究。该研究利用生物信息学方法共鉴定了97个红藻Hsp20基因,并根据系统发育关系将其划分为13个亚家族。系统发育分析表明,红藻Hsp20基因可能具有多系起源和复杂的进化模式。基因结构分析表明,大多数红藻Hsp20基因不具有内含子,所有的红藻Hsp20基因在C端区域都含有一个保守的ACD(α-crystalline domain)结构域。保守基序分析表明,同一亚家族的红藻Hsp20基因具有相似的基序。基因复制分析表明,红藻Hsp20基因家族中存在串联重复和大片段复制事件。此外,红藻中的这些Hsp20基因在进化过程中可能受到了纯化选择,并且条斑紫菜(Pyropia yezoensis)、坛紫菜(Pyropia haitanensis)和脐形紫菜(Porphyra umbilicalisHsp20基因在进化上高度保守。在红藻Hsp20基因启动子序列中发现了植物激素、光、胁迫响应和发育相关的顺式调控元件。最后,以条斑紫菜作为红藻的代表,探讨了红藻Hsp20基因的表达模式。基于RNA-seq数据,发现条斑紫菜Hsp20基因参与了条斑紫菜对非生物和生物胁迫的响应,并表现出不同的表达模式。此外,条斑紫菜Hsp20还参与了条斑紫菜的生长和发育,并表现出空间和时间上的表达模式。这些结果为红藻Hsp20基因家族提供了全面和有价值的信息,并为其功能表征奠定了基础。此外,该研究为红藻Hsp20基因家族的进化提供了新的见解,并将有助于理解红藻对不同环境的适应性。


研究团队

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该项研究工作由海南热带海洋学院崖州湾创新研究院、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、中国海洋大学三亚海洋研究院等单位的相关学者合作完成。茅云翔教授为通讯作者,团队博士生高天为第一作者,莫照兰教授、唐磊博士、于欣孜博士、杜国英副教授等为共同作者。相关工作得到国家自然科学基金、国家重点研发项目、三亚崖州湾科技城科技计划项目、海南省自然科学基金和中国博士后基金等项目资助。

 

论文来源:

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Tian Gao, Zhaolan Mo, Lei Tang, XinZi Yu, Guoying Du, Yunxiang Mao*(2022). Heat Shock Protein 20 Gene Superfamilies in Red Algae: Evolutionary and Functional Diversities. Frontiers in Plant Science. 13: 817852. doi:10.3389/fpls.2022.817852.

论文链接:

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2022.817852/full


      (供稿:水产南繁种业创新中心)